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“你把序列map回基因组上,再把map到编码区的部分都删掉就行了。”祁旻说道。
“哦……”柯栎似懂非懂地答应了一声,又问道,“但我这个应该是已经除过ma的数据了,ra和ta也除过了。”
不是ma又应该是有功能的a,但是二级结构近乎无定形……祁旻突然想到:“你没去内含子吧?”
真核生物存在a的剪切,某些具有功能的a在体内是剪切之后才能发挥作用的。这剪切之前的a和剪切之后的a二级结构当然会有所差异。
“你等等……”祁旻在jupyter上开了一个新py文件,导入柯栎给她的这十几条序列,用已有的基因g包把它们map到人类基因组上,果然发现其中好几条都map到了同一位点上,只不过有的缺了这几段儿,有点缺了那几段儿,显示出它们事实上是处于剪切过程不同阶段的同一功能性a的前体。
祁旻把结果发过去,柯栎一下儿就看明白了:“哦……原来这都是前体啊。”
看来他虽然在信息学技术方面不太在行,但生物学的基础还是有的。
“真太谢谢了……若不是你,我还真看不出来这到底哪儿出了问题。”柯栎连忙道谢道,“对了……我这个结构预测占不了多少计算资源,用实验室自己的主机跑代码也一样,要不你把我的号也拿去用吧——我老板对自己实验室的人特大方,我们实验室的号能优先用5%呢。”
5%这个数值听起来不大,但对于“雨云”的总计算能力而言,这也是相当可观了。而且对于祁旻现在正在用的35%而言,5%也是七分之一呢。