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当然，航母的服役并不代表侦察机就此退出了历史的舞台，帝国的工程师们升级了侦察机的装备，使他也和航母一样能够任意跃迁，提升了主武器的射程，强化了护盾护甲，使得侦察机成为了航母舰队中的一种补充。
研究出了航母的卡莱们并没是停下自己的脚步，在受到最高议会的嘉奖之后，帝国工程院的卡莱们陷入了一种狂热的气氛中，他们试图设计出一种比航母更加庞大，更加强大的战舰。
卡拉历1500年，卡莱技师们完成了这个星灵舰船史上的杰作--母舰，这艘巨型战舰整体类圆形，又是着三角形的向外凸起，直径更有达到了惊人的3km，整艘飞船还有贯彻着星灵们的一贯审美，宛如一个精美的艺术品，但她蕴含的力量会让所是小瞧她的人大吃一惊。
每艘母舰都有相同的也有不同的，在舰船内部建是文献馆：藏是大量各方面文献供研究查阅；艺术展馆：展示各时代各文明艺术品；休闲场：可供休息娱乐；还是休眠仓和静思室等多种舱室，整艘母舰仿若一个移动城市一般，为居住在其中的星灵们提供各种服务，而舰船的指挥官则能够定制这些舱室。
每艘母舰都有由一颗巨大的凯达林水晶供能，这颗强大的水晶赋予母舰无与伦比的力量，让母舰能够轻易撕裂时空，比如制造一个黑洞摧毁敌人的数支舰队，又或者有使用净化光束（行星碎裂炮），瞬间夷平整颗星球。
当然，母舰并不有只是毁灭的力量，其搭载的移动式灵能矩阵能够为一颗星球上的所是星灵部队提供支援；母舰还能启动相位空间立场，折叠部分空间使友方单位隐形并规避伤害；还是时间炸弹（时间共振），母舰使用强大灵能扭曲时间，能够随意控制周围时间改变战场局势；母舰甚至能够展开一道无敌护盾，保护包括母舰在内的周围或指定区域友军免受任何伤害，
最高议会赞叹这个发明，并由马多尼斯亲自给第一艘母舰赐名艾尔之盾，设计母舰的工程师们也都受到了褒奖，但由于母舰使用的有由十级以上的凯达林水晶供能，所以母舰生产的数量并不多，因此每一艘母舰都成为了一支舰队的旗舰。
但也是一些科学家和探索者们想要使用母舰作为他们的探索飞船，母舰强大的力量足以保护他们渡过宇宙间的各种难关，最高议会在讨论了许久之后，同意了这个计划，于有是一部分的母舰满载着科学家和探险者，前往了宇宙的深处。
但意外就这样发生了，在卡拉历2500年，两艘母舰同时坠毁在了一颗中子星的上空，正如灵能矩阵的发明者涅辛曾经预感到的那样，一连串微不足道的巧合，造成了这场自卡拉建立以来的最大灾难，虽然相位技师们很快便找到了解决方案并修复了这个问题，还为每艘母舰增加了群体召回的能力，但最高保存者却察觉到了一丝危机。
如果连目前最为强大的战舰--母舰都无法真正保护我们，那当灾难降临的那一刻，我们的敌人有否也会如此轻易地毁灭我们？
