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儒门内部也有三大派别，分别是理学、心学、气学，分别对应三位大祭酒。
其中理学和心学都是鼎盛一时的显学，正如道门的正一道和全真道，传承有序，不必多言。
气学则如太平道一般，曾经一度近乎覆灭，待到理学和心学大败于道门之手后，这才趁势而起，一跃成为与心学、理学并列的第三大学派。
理学一派的祖师是理学圣人，心学一派的祖师是心学圣人，气学一派的祖师可以追溯到亚圣，“气学”二字中的“气”字便是来源于亚圣提出的“浩然气”，不过真正发扬气学的却是横渠先生等人。
横渠先生正是说出“为天地立心，为生民立命，为往圣继绝学，为万世开太平”的儒门先贤。
气学一派认为世界是由两部分构成的，一部分是看得见的万物，一部分是看不见的，而两部分都是由“气”组成的。
“气”有两种存在方式，一种是凝聚，一种是消散。消散也不是消失得没有此物，只不过是肉眼看不到而已。气学以“太虚“”表示“气”的消散状态，这是本来的原始状态，“气”是“太虚”与万物的合称。
横渠先生又曰：“知虚空即气，则有无、隐显、神化、性命通一无二。”
气学、理学、心学三家之间同根同源又各有分歧。
