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而塞王和大明朝廷之间的关系，同样是依附型的。塞王依附朝廷，朝廷依靠塞王。塞王从朝廷那里得到土地、军费，而朝廷则利用塞王守卫边疆。
不过和明初的塞王体系不同，朱由检新封的塞王体系中多了一个中层力量——在原先的体系中，塞王是顶层，军户是基层，而中层实际上是比较缺乏的。并不是说塞王的卫所没有中层，而是那些中层本身并不是封建主，仅仅是塞王的官僚。
而这样的塞王体系，是现在的朱由检所无法建立的，因为这意味着他得把自己的军队分出去，才能建立起没有中层封建主的塞王封建体系——因为朱由检嫡系的军队是没有中层封建主的，而那些军阀武装或是游牧部落都有自己的体系。
朱由检不可能在不付出相当大的代价的情况下，就把大小军头或大小封建主全部去除，同时保留基层的战士，然后再用自己的军事官僚去管理。
而朱由检的嫡系部队，如果不算新建中的御前军，就只有帐前、殿前两军，人数只有十余万，是朱由检统御天下和拱卫腹心的本钱，当然不可能分给塞王。
所以塞王就只能通过收编和整顿军阀武装和游牧部落，建立自己的封建军队。
对于唐王这样的原大明藩王而言，还有大批追随自己的“一门众”要安置，所以也只能建立一个拥有庞大中层的层层封建体系。
